Sci Rep:5-miRNA关键字特征可作为食管鳞状细胞癌的预后生物标志物

2021-12-06 02:05:19 来源:
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这项数据分析旨在已确定一种可以得出食管鳞状细胞膜癌(ESCC)病变总体生存率(OS)的miRNAs首页。

从NCBI GEO授予119名ESCC病变的miRNA表达明人及其相应的临床资讯,并将其作为操练集。在早期和晚期检验间筛选差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox回归比对、表达式特征消除(RFE)-支持向量机(SVM)算法和LASSO Cox回归框架来辨别病因性miRNAs,从而确立病因评价框架。此外,得出了这些病因性miRNAs的有前途靶突变,然后协作了miRNA靶突变网络。通过功能富集比对,比对了ESCC中这些病因性miRNAs得出靶突变的功能涉及性。

在操练比较大,早期与晚期检验有46个DEmiRNAs。确立了基于5个miRNAs的效用评价框架。该5-miRNA效用评价可以将操练集分为OS时间明显不同的高危组和低危组。在一个来自乳腺癌突变组图明人(TCGA)的脱离数据比较大,成功实验者了5-miRNA效用评价的效用一组能力。已已确定了与这些miRNAs涉及的各种生物学过程和路中,例如Wnt波形路中、TRP通道的发炎介质调节路中和雌激素波形路中。

这项数据分析提示,与病理应于涉及的5-miRNA首页对得出ESCC病变的病因具有临床意义。

原始出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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